Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms