Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNQ9UQP3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms