Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZRN3Q9UPQ7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms