Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF18Q9UNG2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms