Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHA4Q9UN74 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHA4Q9UN74 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA4Q9UN74 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA4Q9UN74 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA4Q9UN74 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA4Q9UN74 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA4Q9UN74 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA4Q9UN74 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA4Q9UN74 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA4Q9UN74 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA4Q9UN74 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA4Q9UN74 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA4Q9UN74 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHA4Q9UN74 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms