Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BARX2Q9UMQ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms