Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms