Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN1Q9ULB1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NRXN1Q9ULB1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms