Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP8AP2Q9UKL3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms