Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHIC2Q9UKJ5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHIC2Q9UKJ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHIC2Q9UKJ5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHIC2Q9UKJ5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CHIC2Q9UKJ5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHIC2Q9UKJ5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHIC2Q9UKJ5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CHIC2Q9UKJ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CHIC2Q9UKJ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms