Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms