Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBD1Q9UJT1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBD1Q9UJT1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms