Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RIMS3Q9UJD0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIMS3Q9UJD0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms