Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms