Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms