Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF1Q9UH73 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF1Q9UH73 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms