Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SWAP70Q9UH65 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SWAP70Q9UH65 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms