Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRRDQ9UH36 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.5 ms