Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PEMTQ9UBM1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms