Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL13Q9P2N7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms