Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCOR3Q9P2K3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms