Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP35Q9P2H5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP35Q9P2H5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
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