Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms