Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNKQ9P0W0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNKQ9P0W0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms