Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAPAQ9P0L0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAPAQ9P0L0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VAPAQ9P0L0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VAPAQ9P0L0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAPAQ9P0L0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAPAQ9P0L0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms