Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMCD1Q9NZU5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms