Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD3Q9NYL9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms