Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms