Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A4Q9NY91 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A4Q9NY91 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms