Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms