Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms