Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms