Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC18Q9NUE0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC18Q9NUE0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms