Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMSN1Q9NSI8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms