Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARHGAP35Q9NRY4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARHGAP35Q9NRY4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms