Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD2Q9NRG4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms