Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD163L1Q9NR16 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD163L1Q9NR16 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms