Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms