Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms