Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC4Q9NPG8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC4Q9NPG8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC4Q9NPG8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC4Q9NPG8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC4Q9NPG8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC4Q9NPG8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC4Q9NPG8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC4Q9NPG8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZDHHC4Q9NPG8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC4Q9NPG8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms