Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms