Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA1Q9NP55 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms