Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD33

MRPL47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL47Q9HD33 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL47Q9HD33 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL47Q9HD33 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms