Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PREBQ9HCU5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms