Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms