Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LIN28AQ9H9Z2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LIN28AQ9H9Z2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms