Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ERVMER34-1Q9H9K5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms