Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8V8

Putative uncharacterized protein FLJ13197, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9H8V8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9H8V8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9H8V8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9H8V8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9H8V8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9H8V8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9H8V8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9H8V8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9H8V8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms