Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STN1Q9H668 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms