Protein–RNA interactions for Protein: Q9H361

PABPC3, Polyadenylate-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC3Q9H361 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC3Q9H361 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC3Q9H361 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC3Q9H361 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC3Q9H361 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC3Q9H361 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC3Q9H361 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC3Q9H361 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms